Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms