Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CEP170Q5SW79 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms