Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAPCD1Q5SSQ6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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