Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms