Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms