Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM3Q53FZ2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms