Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms