Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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