Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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