Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms