Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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