Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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