Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLCA4Q14CN2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms