Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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