Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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