Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms