Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTGDRQ13258 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGDRQ13258 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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