Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STX4Q12846 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STX4Q12846 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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