Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms