Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms