Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms