Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNT1Q02742 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms