Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms