Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX1P83916 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX1P83916 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX1P83916 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms