Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMF1P82094 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMF1P82094 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMF1P82094 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMF1P82094 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms