Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms