Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NME5P56597 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
NME5P56597 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NME5P56597 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME5P56597 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms