Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB28P51157 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB28P51157 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB28P51157 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB28P51157 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB28P51157 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB28P51157 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB28P51157 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB28P51157 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms