Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNCAP37840 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNCAP37840 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNCAP37840 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SNCAP37840 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNCAP37840 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms