Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACVR1BP36896 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms