Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF4P34130 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF4P34130 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTF4P34130 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms