Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms