Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF1P22415 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF1P22415 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
USF1P22415 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF1P22415 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF1P22415 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF1P22415 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF1P22415 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF1P22415 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF1P22415 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms