Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DPA1P20036 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms