Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms