Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms