Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GATA1P15976 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GATA1P15976 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GATA1P15976 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GATA1P15976 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GATA1P15976 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GATA1P15976 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GATA1P15976 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GATA1P15976 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms