Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms