Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms