Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms