Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP19O94966 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP19O94966 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP19O94966 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP19O94966 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP19O94966 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP19O94966 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP19O94966 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP19O94966 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP19O94966 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP19O94966 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP19O94966 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP19O94966 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms