Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCATO75600 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCATO75600 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCATO75600 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCATO75600 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms