Protein–RNA interactions for Protein: O75340

PDCD6, Programmed cell death protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6O75340 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD6O75340 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms