Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms