Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQ87 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQ87 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQ87 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQ87 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQ87 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQ87 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQ87 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms