Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms