Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC5Q9UQL6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms