Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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