Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms