Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNL1Q9UK58 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL1Q9UK58 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms